人文学部
文化学科、社会科学科
教育学部
学校教育教员培养课程、信息教育课程、生涯教育课程、人类发达科学课程、附属教育实践综合中心、附属小学校、附属中学校、附属养护学校、附属幼儿园
工学部
机械工学科、电气电子工学科、分子素材工学科、建筑学科、信息工学科、物理工学科
生物资源学部
资源循环学科、共生环境学科、生物圏生命科学科、附属纪伊・黑潮生命地域フィールドサイエンス中心、附属练习船势水丸　　
医学部
医学科、护理学科、附属医院
大学院
人文社会科学研究科 (硕士课程)
教育学研究科 (硕士课程)
医学系研究科（硕士课程）（博士课程）
工学研究科 （博士课程）
生物资源学研究科 （博士课程）
大学院专业设置 研究科 专业设置 人文社会科学研究科 地域文化论（地域社会文化论、地域言语文化论）、社会科学（地域行政政策、地域经营法务） 教育学研究科 学校教育、特别支援教育、教科教育（国语教育、社会科教育、数学教育、理科教育、音乐教育、美术教育、保健体育、技术教育、家政教育、英语教育） 医学系研究科 医科学（基因再生医学、神经感觉医学、病态阐明医学、病态控制医学、病态修复医学、环境社会医学）、看护学（基础看护学、成人看护学、母子看护学、精神·老年看护学） 工学研究科 机械工学（量子·电子机械、机能加工、环境能源）、电气电子工学（电气系统工学、情报·通信系统工学、电子物性工学）、分子素材工学（分子设计化学、生物机能工学、素材化学）、建筑学（建筑设计、建筑管理）、情报工学（计算机科学、智能工学）、物理工学（量子工学、纳米工学） 生物资源学研究科 资源循环学（物质循环学、循环生物工学、循环社会系统学）、共生环境学（地域保全工学、环境情报系统工学、森林资源环境学、自然环境系统学）、生物圈生命科学（生命机能科学、海洋生物科学、陆圈生物生产学、水圈生物生产学） 创造开发研究中心
生命科学研究支援中心
留学生中心
综合信息处理中心