现在有“琉球复国运动”相关组织存在，声明琉球的独立性和复国的必要性。琉球大学1996年所作的一项调查显示，38.4%认为冲绳应在财政预算方面独立；13.2%认为冲绳应在除外交以外所有方面独立，15%认为冲绳应该完全独立。同时42.6%自称为“冲绳人”，29.1%自称“冲绳人”和“日本人”，3%自称“日本人”。
嘉利吉俱乐部
1970年6月，以大众金融公库原总裁崎间敏胜与注册会计师野底武彦为中心的“琉球独立党”结成。崎间曾于1971年参加第9届日本参议院议员通常选举，以2673票落选。1972年5月15日，美国将琉球群岛移交日本政府管理。1978年7月30日冲绳发生730事件后，琉球独立党的活动陷入停止状态。2005年8月15日，琉球独立党选举屋良朝助为第二代党首，野底武彦为名誉党首，再次活跃起来。2006年，屋良朝助参加冲绳县知事选举，得6220票，以得票率0.93%落选。2008年3月3日，琉球独立党召开记者会，正式更党名为“嘉利吉俱乐部”，确定党旗为“三星天洋旗”，并作为设想中未来琉球共和国的国旗。
琉球民族独立综合研究学会
2013年5月15日，由冲绳社会活动家和学者组成的“琉球独立”组织“琉球民族独立综合研究学会”公开宣布成立，其组织发起人是日本龙谷大学教授松岛泰。自称出生于 “琉球石垣岛”的松岛驳斥了一些右翼媒体关于“琉球民族独立综合研究学会”成立是与中国舆论“协调作战”的说法。他称，是日美政府对冲绳的“殖民地化”，使得“琉球人”对日本的不满和绝望感蔓延，因此期望通过向联合国申诉等方式来推动对“琉球独立”问题的全民公决，这也是该组织追求的长期目标。 1970年前后，支持在台琉球人的“琉球复国运动”，法律上不承认琉球为日本领土。
1925年，闻一多的七子之歌之台湾写道“琉球是我的群弟，我就是台湾”，这是当时中国人的普遍看法。
日本发动二次大战后，中国国民政府曾提出要光复琉球。1938年4月，蒋介石在国民党临时全国代表大会上发表讲话：“日本自明治以来，早就有一贯的大陆侵略计划。过去甲午之战，他侵占我们的台湾和琉球，日俄战后吞并了朝鲜，侵夺我们旅顺和大连，就已完成了他大陆政策的初步；他就以台湾为南进的根据地，想从此侵略我们华南和华东；而以朝鲜和旅大为他北进的根据地，由此进攻我们的满蒙和华北。台湾是中国的领土，中国要讲求真正的国防，要维护东亚永久的和平，断不能让高丽和台湾掌握在日本帝国主义者之手，必须针对着日本之积极侵略的阴谋，以解放高丽、台湾的人民为我们的职志。”1945年，占领琉球群岛美军建议由中国托管，但由于中国发生了内战，无暇顾及这个在东海之中的美丽的群岛。 琉球的问题非常复杂。学者汪晖在文章中提出，在有关东北亚地区的战争与和平的讨论中，琉球占据着一个特殊的但常常为人忽视的地位。美国的军事占领仍然存在，它既是冷战的构造，又是全球化的军事结构的体现。1972年5月15日，琉球被美国“归还”给日本，但矛盾随之而来：首先，日本并不能主宰“回归后的”琉球事务，太平洋战争的权力关系仍然凝聚在琉球的上空；其次，琉球与日本的历史不可能妥帖地放在“回归”这个概念之下。如果“回归”是对近代日本扩张历史的承认，那么，“回归”也意味着琉球的反占领运动将发展为与日本政府的矛盾。即便绕过这个“回归”概念，从冷战时代至今，日本的主权不得不受制于冷战时代的政治格局；在这样的条件下，从民族国家逻辑的角度说，琉球不能不游移于认同日本与独立于日本这两个选择之间。（在战后最初的年代，琉球甚至被迫考虑成为美国的一部分的可能性。）
因此，在日本本土，有关琉球问题的讨论围绕着美军对琉球的占领而展开，而在琉球，这一讨论又涉及琉球是不是日本的一部分，琉球是不是应该独立这样的问题。由于军事霸权与当地劳动关系、土地关系相互渗透，并与日美关系、安保条约和日美军事同盟问题纠缠在一起，任何对琉球问题的讨论都不可避免地与美国、日本、俄罗斯、中国、周边区域及后冷战时代的霸权构造密切相关。未来日本在这个区域的角色也取决于这个构造的变化。在这个意义上，琉球问题甚至不仅是东亚的问题，它是整个世界资本主义发展、帝国主义发展在这个区域的集中的一个展现。