截至2015年2月，筑波大学有国际联合共用设施4个、校内共用教育研究设施（科学研究类）18个、世界先端研究开发支援组织2个。
国际联合共用设施（4个）：计算科学研究中心、下田临海实验中心、遗传基因实验中心、等离子体研究中心
世界先端研究开发支援组织（2个）：生物体机器人研究中心、分子行动科学研究中心
校内共用教育研究设施（科学研究类）（18个）：生命领域跨学科研究中心 （TARA）、农林技术中心、生命科学动物资源中心（旧：动物实验中心）、菅平高原实验中心、大学研究中心、质子线医学应用研究中心、产学结合共同研究中心 、教育开发国际合作研究中心、知识型社会基础研究中心、跨学科物质科学研究中心（TIMS）、特别支援教育研究中心、北非研究中心、学术信息媒体中心、研究基础综合中心、同位素环境动态研究中心、放射线安全管理部（旧：同位素综合中心）、陆域环境研究中心（旧：水理实验中心）、次世代医疗研究开发教育统合中心（CREIL） 、半机器人（Cybernics）研究中心 、风险企业实验室 科研概况 平成18-24年科学研究经费一览　　年度平成18年　　平成19年平成20年平成21年平成22年平成23年平成24年项目数 1061 1075 1078 1157 1269 1366 1433 总金额（単位：千丹） 3309310 3359123 3275771 3759909 3399760 3882068 4134265 （表格内容资料来源：2015年2月筑波大学官网） 世界先端研究开发支持项目名称主要研究者单位为健康长寿型社会服务的支援人类技术最先端研究项目山海嘉之人・机器人・信息一体化融合研究核心探索高级神经活动的分子基础及控制方法柳泽正史分子行动科学研究核心备注：研究期间为2010年3月10日～2014年3月31日（表格内容资料来源：2015年2月筑波大学官网）
影响因子 根据2014年3月《自然》发布的年度自然出版指数（日本机构排名）报告，筑波大学2013年《自然》杂志高质量论文的贡献指数位列第15名。 研究文章　　排名（日本机构）机构CC2Articles31日本东京大学（UTokyo）56.11542物理和化学研究所（理），日本32.691223日本京都大学29.12774日本大阪大学19.79755日本东北大学12.99516日本东京理工学院11.06307日本九州大学9.99438日本名古屋大学7.64369日本北海道大学7.392210日本NTT集团6.871111国家先进工业科学技术（产业），日本6.22612日本国家材料科学研究所（净利）5.832513日本海洋地球科技机构（JAMSTEC），日本5.351614日本横滨市立大学（YCU）5.271515日本筑波大学4.2311备注：以上为1-15名的名单，详细名单请参考资料 　　 中国科学院大学（旧：中国科学院研究生院）
2005.07
浙江大学
2007.11
南开大学
2007.12
吉林大学
2008.02
西安交通大学
2008.02
北京航空航天大学
2008.02
厦门大学
2008.05
中国科学技术大学
2009.04
东北师范大学
2009.04
北京师范大学
2011.04
北京大学
2011.10
华东师范大学
2012.07
大连民族学院
2013.03
吉林农业大学
2004.02
湖南大学 外国语学院
1996.03
上海交通大学
1997.02
上海图书馆
1999.10
清华大学
2002.02
中国原子能科学研究院
2002.08
沈阳农业大学
2004.02
清华大学
2005.05
中国地质大学
2005.11
郑州大学
2005.11
大连大学
2007.02
中国科学院　地理科学・资源研究所
2007.04
云南大学
2008.03
南京大学环境学院
2008.04
清华大学环境学院
2008.05
中国美术学院
2008.05
南京大学电子科学与工程学院
2009.01
江南大学 生物工程学院
2010.09
中国科学院
2010.12中国人民大学
2013.06浙江科技学院
2013.07
南京农业大学
2014.02
复旦大学 环境科学与工程系
2014.03 澳门大学 社会科学及人文学院
2010.03
香港理工大学
2014.11
香港中文大学
2015.02 国立台湾大学
2007.11
国立台湾大学
2015.04（更新）
国立清华大学
2007.11
国立台湾师范大学
2012.12
辅仁大学
2014.04
国立成功大学
2014.05
国立台湾芸术大学 美术学院，设计学院，造形芸术研究所
2005.07
国立政治大学 文学院 ，社会科学院 ，外国语文学院 ，法学院
2006.06
国立台湾科技大学
2008.09
国立交通大学 电机学院
2010.08
国立屏东科技大学
2011.11
国立彰化师范大学 教育学院
2013.03
国立防灾科学技术中心
2013.10
高雄医学大学
2014.09