这两个词基本没什么关联，自然也说不上区别了。ください本身是请给我做某事的意思，不是那么客气。当敬语需要ご～ください，お～ください这类形式，中间是动词，意思是请对方做某个动作。ございます是あります的敬语。本身是“有”的意思，也能和其他的用法搭配着用，各自不同。